Стерилизующая фильтрация широко используется в фармацевтическом производстве для очистки растворов, вакцин, инъекционных препаратов и биотехнологических продуктов. В биотехнологии она применяется для работы с клеточными культурами, ферментными растворами и питательными средами. Медицинская промышленность использует этот метод для очистки компонентов перед стерилизацией, а в пищевой отрасли фильтрация помогает удалять микроорганизмы из напитков, молочных продуктов и ферментированных растворов. Также лаборатории применяют стерилизующую фильтрацию для подготовки проб к анализам, где важна максимальная чистота.